More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3875 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
256 aa  524  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  97.27 
 
 
256 aa  487  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  80.08 
 
 
256 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.97 
 
 
256 aa  362  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  61.26 
 
 
255 aa  311  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.42 
 
 
256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  59.68 
 
 
257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  59.68 
 
 
260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.89 
 
 
260 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.52 
 
 
256 aa  280  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.78 
 
 
256 aa  275  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  52.8 
 
 
255 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.2 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  50.8 
 
 
255 aa  265  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.38 
 
 
255 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.6 
 
 
255 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.61 
 
 
255 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  48.22 
 
 
256 aa  255  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.81 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.61 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.43 
 
 
259 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.01 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
255 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.22 
 
 
256 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.04 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.45 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  48.24 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.04 
 
 
259 aa  242  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  50.21 
 
 
256 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.85 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.85 
 
 
254 aa  232  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  47.64 
 
 
255 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.24 
 
 
255 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.77 
 
 
242 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 
248 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.48 
 
 
278 aa  227  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.88 
 
 
256 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.11 
 
 
242 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.47 
 
 
271 aa  218  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.51 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  47.79 
 
 
227 aa  211  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.85 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.52 
 
 
248 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.8 
 
 
257 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.8 
 
 
257 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.15 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 
257 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.08 
 
 
258 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  42.91 
 
 
252 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.31 
 
 
257 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.8 
 
 
254 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.46 
 
 
257 aa  185  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.54 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.15 
 
 
257 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  40.48 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.37 
 
 
257 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.37 
 
 
257 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.89 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  38.85 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  41.94 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.94 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.7 
 
 
259 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.08 
 
 
259 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  41 
 
 
264 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.31 
 
 
256 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.31 
 
 
259 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.92 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.08 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.69 
 
 
259 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.94 
 
 
250 aa  168  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  38.83 
 
 
284 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.89 
 
 
258 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
267 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  37.89 
 
 
252 aa  165  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.57 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  40.38 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.75 
 
 
245 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.4 
 
 
251 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.93 
 
 
240 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  35.93 
 
 
265 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.52 
 
 
252 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  36.4 
 
 
257 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.4 
 
 
257 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.35 
 
 
263 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.22 
 
 
259 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.75 
 
 
267 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.43 
 
 
251 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.91 
 
 
263 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.06 
 
 
273 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.84 
 
 
295 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.84 
 
 
295 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.43 
 
 
266 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.52 
 
 
252 aa  154  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.55 
 
 
256 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  37.13 
 
 
266 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.38 
 
 
269 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  37.69 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.25 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.55 
 
 
251 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>