More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3823 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  94.19 
 
 
258 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  60 
 
 
236 aa  298  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  62.6 
 
 
258 aa  272  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  55.36 
 
 
262 aa  258  5e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  52.03 
 
 
262 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  55.36 
 
 
262 aa  248  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
271 aa  219  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
258 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  48.47 
 
 
270 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  52.59 
 
 
270 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  51.52 
 
 
255 aa  215  6e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  50.22 
 
 
255 aa  214  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  49.17 
 
 
255 aa  213  3e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  48.28 
 
 
267 aa  211  6e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  45 
 
 
271 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  45.85 
 
 
253 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  45.8 
 
 
255 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  46.61 
 
 
272 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
268 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  45.76 
 
 
254 aa  196  2e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  45.26 
 
 
264 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
269 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  44.3 
 
 
251 aa  191  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  50.42 
 
 
264 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
279 aa  183  2e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  8.49043e-05 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  38.49 
 
 
255 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
246 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  39.24 
 
 
242 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  38.53 
 
 
248 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.24 
 
 
238 aa  147  2e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.02342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 
215 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  39.37 
 
 
238 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34.98 
 
 
243 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.44 
 
 
230 aa  139  4e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  38.82 
 
 
245 aa  139  5e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.43751e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 
239 aa  138  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  34.89 
 
 
269 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  40.47 
 
 
260 aa  131  1e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  33.48 
 
 
240 aa  130  2e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.92 
 
 
240 aa  130  2e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  31.6 
 
 
230 aa  130  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 
217 aa  129  4e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  34.65 
 
 
242 aa  127  2e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 
229 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  41.14 
 
 
231 aa  125  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 
239 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  34.33 
 
 
233 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
239 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  33.92 
 
 
240 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  34.07 
 
 
237 aa  121  1e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.95242e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.93 
 
 
227 aa  119  4e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.80305e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
247 aa  117  2e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  33.89 
 
 
262 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  33.92 
 
 
243 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
259 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  36.32 
 
 
237 aa  115  1e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  35.19 
 
 
258 aa  113  4e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  30.47 
 
 
263 aa  112  8e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.98 
 
 
215 aa  111  1e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
245 aa  110  2e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  32.66 
 
 
299 aa  110  2e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  32.46 
 
 
242 aa  110  2e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  30.86 
 
 
237 aa  109  4e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  33.9 
 
 
228 aa  109  4e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.74 
 
 
233 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  1.70778e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  32.31 
 
 
230 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 
230 aa  108  7e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  7.15358e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 
279 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.54112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  36.13 
 
 
245 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  30.87 
 
 
233 aa  105  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.15929e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  31.36 
 
 
227 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  30 
 
 
233 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
231 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.56 
 
 
234 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  35.81 
 
 
239 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.56 
 
 
234 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  31.96 
 
 
247 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  25.85 
 
 
270 aa  103  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
247 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.28235e-09  hitchhiker  2.30998e-07 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.47 
 
 
223 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  2.98653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  34.19 
 
 
255 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  31.06 
 
 
244 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
239 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.78 
 
 
261 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  33.47 
 
 
256 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  33.61 
 
 
268 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  32.74 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  31.06 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.96 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
232 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  32.63 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  34.78 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.28 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
239 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.44 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
226 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>