175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3756 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
636 aa  1298    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  63.35 
 
 
639 aa  818    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  63.21 
 
 
639 aa  791    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  87.74 
 
 
636 aa  1163    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.08 
 
 
627 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.71 
 
 
673 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.37 
 
 
673 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  35.39 
 
 
637 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  38.44 
 
 
639 aa  336  7.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  40.5 
 
 
639 aa  334  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32.48 
 
 
602 aa  333  8e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.26 
 
 
834 aa  304  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.37 
 
 
605 aa  293  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  41.26 
 
 
795 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.14 
 
 
618 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.99 
 
 
553 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 
795 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.1 
 
 
613 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.73 
 
 
618 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
762 aa  273  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.27 
 
 
609 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.91 
 
 
905 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  39.23 
 
 
736 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.18 
 
 
775 aa  269  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.51 
 
 
772 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  36.62 
 
 
776 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  38.52 
 
 
777 aa  267  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.77 
 
 
533 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.88 
 
 
779 aa  266  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.2 
 
 
613 aa  266  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.69 
 
 
655 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
774 aa  261  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.62 
 
 
526 aa  260  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.48 
 
 
766 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.2 
 
 
790 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.84 
 
 
785 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.85 
 
 
534 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 
542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.26 
 
 
634 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 
765 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.22 
 
 
549 aa  251  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.81 
 
 
821 aa  250  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.92 
 
 
505 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.92 
 
 
781 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.7 
 
 
858 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.04 
 
 
812 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.91 
 
 
534 aa  243  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
779 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.98 
 
 
529 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.16 
 
 
812 aa  241  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.27 
 
 
527 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 
866 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.1 
 
 
546 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.44 
 
 
760 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.68 
 
 
593 aa  226  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.78 
 
 
515 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 
543 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
547 aa  223  9e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.6 
 
 
853 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.08 
 
 
665 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
584 aa  217  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.8 
 
 
469 aa  217  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.01 
 
 
422 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.98 
 
 
888 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 
863 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  33 
 
 
888 aa  213  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 
493 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.33 
 
 
688 aa  211  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.85 
 
 
868 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.08 
 
 
852 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.01 
 
 
888 aa  207  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.96 
 
 
614 aa  207  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.5 
 
 
481 aa  207  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.45 
 
 
504 aa  206  9e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  29.51 
 
 
889 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 
549 aa  206  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.56 
 
 
906 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.7 
 
 
545 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.58 
 
 
528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.42 
 
 
884 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.48 
 
 
525 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.74 
 
 
910 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.27 
 
 
683 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.96 
 
 
525 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  31.56 
 
 
896 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.74 
 
 
913 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.52 
 
 
915 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.46 
 
 
447 aa  197  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.11 
 
 
900 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.8 
 
 
857 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.97 
 
 
913 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.33 
 
 
500 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.43 
 
 
797 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.53 
 
 
628 aa  190  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.75 
 
 
794 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.95 
 
 
807 aa  187  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.13 
 
 
811 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  31.01 
 
 
879 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  30.93 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.72 
 
 
896 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>