27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3729 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  56.59 
 
 		 220 aa  254  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  54.46 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  54.27 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  51.23 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  53.92 
 
 		 220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  47.47 
 
 		 222 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  49.75 
 
 		 221 aa  204  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  30.32 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  25.36 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  27.54 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  25.13 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  23.81 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  25.22 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  29.73 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 222 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 222 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 222 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  26.7 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  26.7 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  26.7 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  26.7 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  26.7 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  26.7 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>