More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3663 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 
723 aa  1448    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  74.51 
 
 
725 aa  1071    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  95.02 
 
 
723 aa  1380    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  45.31 
 
 
764 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.63 
 
 
753 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  46.17 
 
 
756 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  44.93 
 
 
760 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  45.62 
 
 
759 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  40.6 
 
 
729 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  35.4 
 
 
744 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  39.34 
 
 
731 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  38.43 
 
 
729 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.53 
 
 
754 aa  362  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  33.97 
 
 
721 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.72 
 
 
737 aa  298  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.72 
 
 
758 aa  290  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.28 
 
 
696 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.84 
 
 
734 aa  273  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.87 
 
 
741 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  33.97 
 
 
670 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.31 
 
 
658 aa  263  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.77 
 
 
656 aa  257  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 
738 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.82 
 
 
643 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 
746 aa  251  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.19 
 
 
672 aa  249  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.74 
 
 
758 aa  246  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  30.25 
 
 
753 aa  236  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 
701 aa  236  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  26.16 
 
 
758 aa  234  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  25.94 
 
 
758 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.33 
 
 
657 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 
752 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  28.84 
 
 
794 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 
667 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 
645 aa  206  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  27.26 
 
 
665 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.69 
 
 
694 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.87 
 
 
641 aa  195  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  27.8 
 
 
614 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.3 
 
 
656 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  33.05 
 
 
499 aa  187  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  40.56 
 
 
650 aa  181  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.94 
 
 
936 aa  180  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.56 
 
 
761 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  32.64 
 
 
717 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 
696 aa  173  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  28.67 
 
 
635 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  31.23 
 
 
708 aa  168  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.02 
 
 
652 aa  168  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  33.72 
 
 
499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 
735 aa  163  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.65 
 
 
638 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.83 
 
 
607 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.08 
 
 
597 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.42 
 
 
701 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  37.27 
 
 
483 aa  153  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  36.82 
 
 
483 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  31.53 
 
 
675 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  37.19 
 
 
702 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  38.12 
 
 
636 aa  150  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 
864 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.83 
 
 
703 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.95 
 
 
678 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  34.96 
 
 
641 aa  147  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.45 
 
 
701 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.08 
 
 
860 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
858 aa  145  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  34.45 
 
 
701 aa  144  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
744 aa  144  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 
699 aa  143  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.74 
 
 
611 aa  143  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.06 
 
 
861 aa  143  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.23 
 
 
284 aa  141  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25 
 
 
757 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
859 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 
1207 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
911 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  42.05 
 
 
651 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 
724 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  26.07 
 
 
632 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  34.53 
 
 
441 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  34.08 
 
 
431 aa  134  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  25.48 
 
 
645 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  30.31 
 
 
681 aa  134  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  32.66 
 
 
713 aa  133  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  33.2 
 
 
712 aa  134  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  43.46 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  35.16 
 
 
726 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  31.81 
 
 
671 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  25.49 
 
 
582 aa  127  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  34.92 
 
 
536 aa  127  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  24.13 
 
 
643 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  35.32 
 
 
523 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 
643 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.43 
 
 
637 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.17 
 
 
648 aa  122  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  37.56 
 
 
903 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  38.78 
 
 
528 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>