222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3579 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  90.36 
 
 		 280 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  40.15 
 
 		 276 aa  221  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  47.1 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 299 aa  218  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  43.91 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  41.82 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  41.7 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  45.09 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  43.12 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  41.85 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  42.8 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  43.07 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  42.75 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  42.29 
 
 		 278 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 284 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  42.91 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  40.08 
 
 		 259 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  40.93 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  40.14 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  41.42 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  43.36 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  41.15 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  45.2 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1226  putative DNA-binding protein  44.11 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1067  hypothetical protein  44.11 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1073  hypothetical protein  44.11 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  43.73 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  43.73 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  43.73 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  41.2 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  40.87 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  39.03 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  37.41 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 270 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1603  hypothetical protein  43.35 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  42.4 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  39.41 
 
 		 306 aa  171  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  38.2 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2432  XRE family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.732467  normal  0.678442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  37.97 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  41.86 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  41.91 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  38.93 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  38.2 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  42.75 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  39.85 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40.55 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  38.11 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2362  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 318 aa  161  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  38.7 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  37.88 
 
 		 287 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  40.47 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 284 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  42.08 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  41.88 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  41.31 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  37.4 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  39.86 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  39.76 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  41.64 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  37.88 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>