More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3432 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  100 
 
 		 252 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.97 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.97 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.02 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.33 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0918  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  89  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 218 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  33.33 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30.05 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  30.12 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  27.23 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  28.92 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.04 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.12 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 318 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  31.58 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  31.58 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  31.58 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  31.58 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  31.58 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  31.58 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30.05 
 
 		 215 aa  85.1  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  28.79 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  32.49 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  30.63 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  34.06 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  30.95 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  28.93 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  28.5 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.88 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  29.96 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  31.53 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  30.77 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  32.75 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  25.78 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5838  GntR domain-containing protein  29.67 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  30.3 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  28.18 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  28.38 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32.51 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  30.49 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  29.63 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  28.95 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  29.7 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  27.98 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  27.98 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  31.86 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  27.93 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  26.34 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  26.45 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.38 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  30.29 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>