146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3407 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  82 
 
 
459 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  100 
 
 
461 aa  932    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  34.55 
 
 
427 aa  243  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  33.72 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  31.79 
 
 
426 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  30.39 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  32.53 
 
 
411 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  31.54 
 
 
437 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  33.53 
 
 
410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  33.53 
 
 
410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  33.03 
 
 
452 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  30.27 
 
 
435 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  30.45 
 
 
438 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  29.35 
 
 
434 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  29.4 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  26.42 
 
 
415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  26.15 
 
 
415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  25.47 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  28.21 
 
 
451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  25.2 
 
 
425 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  25.35 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  26.87 
 
 
451 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  26.9 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  22.92 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  26.15 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  34.25 
 
 
191 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  39.17 
 
 
234 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  34.25 
 
 
191 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  42.86 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  37.27 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  25.73 
 
 
816 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  37.27 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  26.36 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  37.31 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  26.36 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  33.09 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  36.92 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  36.92 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  33.09 
 
 
175 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  24.59 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  32.89 
 
 
191 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  36.57 
 
 
196 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  37.5 
 
 
195 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  24.94 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  39.09 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  45.05 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  24.93 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  34.94 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  26.74 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  32.74 
 
 
192 aa  69.7  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.61 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  26.22 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  33.64 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  40.34 
 
 
196 aa  67  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  34.55 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  36.44 
 
 
213 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  31.54 
 
 
193 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  35.63 
 
 
185 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  35.63 
 
 
185 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  32.35 
 
 
247 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  37.27 
 
 
220 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  35.29 
 
 
192 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  35.29 
 
 
192 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  35.29 
 
 
192 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
208 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  34.48 
 
 
185 aa  61.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  26.49 
 
 
192 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.01 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  36.13 
 
 
190 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  26.7 
 
 
200 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  36.36 
 
 
190 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  32.53 
 
 
153 aa  57.4  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  35.87 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.85 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  25.83 
 
 
178 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  26.82 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.15 
 
 
193 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  33.62 
 
 
252 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.41 
 
 
152 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  29.84 
 
 
205 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.43 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.4 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.67 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  27.22 
 
 
178 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  24.91 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  28.38 
 
 
177 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.79 
 
 
435 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  29.66 
 
 
344 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.66 
 
 
440 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  37.11 
 
 
348 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  34.12 
 
 
177 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  26.17 
 
 
184 aa  50.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.15 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  30.89 
 
 
214 aa  50.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  27.87 
 
 
205 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  32.5 
 
 
192 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.8 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.69 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  28.8 
 
 
948 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>