More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3393 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  96.6 
 
 		 412 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  86.17 
 
 		 412 aa  737    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 412 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  62.53 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  50.52 
 
 		 444 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  45.03 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  38.35 
 
 		 415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 		 455 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.72 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 439 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  28.03 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 424 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 426 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  26.28 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 432 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  31.63 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  31.63 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.45 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  26.65 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.4 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  26.33 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.5 
 
 		 402 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.35 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.13 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.07 
 
 		 434 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  29.51 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.53 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.51 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.51 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2539  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.45 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.93 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 420 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.93 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.93 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.76 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  29.35 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  30.34 
 
 		 450 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 450 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 450 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.3 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.66 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>