32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3374 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  53.98 
 
 
705 aa  768    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  100 
 
 
702 aa  1439    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  68.79 
 
 
704 aa  1026    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  50.07 
 
 
744 aa  699    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  40.61 
 
 
721 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  27.66 
 
 
770 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  26.77 
 
 
773 aa  229  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  24.83 
 
 
754 aa  190  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  22.86 
 
 
685 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  24.51 
 
 
690 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  23.42 
 
 
557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  23.95 
 
 
718 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  23.97 
 
 
675 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  23.71 
 
 
715 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  22.52 
 
 
682 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0780  hypothetical protein  19.95 
 
 
638 aa  58.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.27648  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  28.64 
 
 
406 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  24.88 
 
 
830 aa  52.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  24.26 
 
 
437 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  25.13 
 
 
395 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  23.29 
 
 
685 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4556  hypothetical protein  23.28 
 
 
676 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000198635  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  25.73 
 
 
380 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  27.27 
 
 
760 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2556  hypothetical protein  30.3 
 
 
1137 aa  48.9  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0932  hypothetical protein  21 
 
 
631 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  decreased coverage  0.000145164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  31.01 
 
 
410 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5676  hypothetical protein  27.46 
 
 
683 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497659  normal  0.0593404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  24.61 
 
 
535 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  31.68 
 
 
422 aa  44.3  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  33.66 
 
 
422 aa  44.3  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  24.61 
 
 
535 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>