More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3272 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  92.78 
 
 
264 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  60.92 
 
 
262 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  56.7 
 
 
267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  54.69 
 
 
260 aa  288  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  52.69 
 
 
260 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  51.72 
 
 
270 aa  275  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  54.33 
 
 
257 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  52.49 
 
 
263 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  44.83 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  41.89 
 
 
262 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  43.68 
 
 
258 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  46.53 
 
 
262 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  38.1 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  44.53 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  41.41 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  37.55 
 
 
266 aa  178  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  40.61 
 
 
269 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.16 
 
 
256 aa  178  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  39.46 
 
 
268 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  37.36 
 
 
270 aa  175  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 
266 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  40.73 
 
 
261 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 
266 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 
266 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  40.77 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  36.05 
 
 
254 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  41.74 
 
 
261 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  38.04 
 
 
288 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  37.25 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  37.25 
 
 
290 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  36.19 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  37.41 
 
 
264 aa  165  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  36.86 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  36.5 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  38.64 
 
 
255 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
293 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  37.6 
 
 
258 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  35.96 
 
 
254 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  36.47 
 
 
269 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 
255 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  38.46 
 
 
265 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  39.77 
 
 
255 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  37.25 
 
 
264 aa  158  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  35.02 
 
 
272 aa  158  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  37.8 
 
 
265 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  36.88 
 
 
269 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  37.31 
 
 
282 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  33.98 
 
 
260 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  37.26 
 
 
292 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  38.64 
 
 
255 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  37.5 
 
 
255 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  35.61 
 
 
272 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  39.08 
 
 
271 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  38.58 
 
 
271 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  33.73 
 
 
259 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  40.08 
 
 
259 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  37.74 
 
 
418 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  36.68 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.88 
 
 
409 aa  152  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  33.84 
 
 
260 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  35.02 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  34.24 
 
 
274 aa  151  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  38.49 
 
 
255 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
259 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  35.61 
 
 
255 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
262 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  37.69 
 
 
264 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  36.8 
 
 
260 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  37.07 
 
 
253 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  38.58 
 
 
271 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  35 
 
 
424 aa  148  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  32.45 
 
 
259 aa  148  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  34.71 
 
 
405 aa  148  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  36.78 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.21 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  37.34 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.57 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  36.09 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  36.25 
 
 
427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  33.98 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  35.66 
 
 
255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.94 
 
 
251 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  39.76 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  38.82 
 
 
260 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  35.66 
 
 
265 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
263 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
259 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  37.86 
 
 
260 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  36.15 
 
 
260 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  35 
 
 
490 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  35 
 
 
264 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  37.27 
 
 
490 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  34.87 
 
 
419 aa  142  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
269 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.27 
 
 
253 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
262 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  34.3 
 
 
424 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  35.06 
 
 
252 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>