238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3241 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
233 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  93.07 
 
 
235 aa  453  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  75.44 
 
 
241 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  73.48 
 
 
233 aa  361  5e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  71.81 
 
 
261 aa  340  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  65.35 
 
 
229 aa  314  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  61.5 
 
 
230 aa  301  7e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  61.06 
 
 
230 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  60.62 
 
 
230 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  63.59 
 
 
243 aa  295  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  59.73 
 
 
230 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  59.65 
 
 
229 aa  292  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  62.22 
 
 
241 aa  292  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 
232 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  61.4 
 
 
231 aa  291  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  62.77 
 
 
234 aa  291  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  58.85 
 
 
231 aa  289  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  58.85 
 
 
231 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  60.18 
 
 
240 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  3.21985e-05  hitchhiker  1.31635e-09 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  57.52 
 
 
231 aa  285  3e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  60.62 
 
 
253 aa  284  7e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  59.47 
 
 
230 aa  284  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  60.18 
 
 
253 aa  283  1e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  59.03 
 
 
230 aa  283  2e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 
229 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  61.72 
 
 
218 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  58.3 
 
 
269 aa  267  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.1966e-11  hitchhiker  5.89305e-06 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  60.53 
 
 
237 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 
225 aa  265  7e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  55.26 
 
 
245 aa  263  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  54.13 
 
 
224 aa  262  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  57.33 
 
 
226 aa  260  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  56.94 
 
 
225 aa  260  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 
226 aa  259  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 
225 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 
222 aa  257  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 
223 aa  255  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  51.57 
 
 
226 aa  254  6e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  54.91 
 
 
229 aa  254  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  54.91 
 
 
229 aa  254  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  54.91 
 
 
229 aa  254  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.00069e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  54.91 
 
 
229 aa  254  7e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 
221 aa  254  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 
223 aa  253  2e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
229 aa  253  2e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  55.09 
 
 
226 aa  253  2e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
229 aa  253  2e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  55.81 
 
 
228 aa  253  2e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  55.81 
 
 
228 aa  253  2e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
229 aa  252  4e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  54.46 
 
 
229 aa  252  4e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 
229 aa  251  5e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
222 aa  251  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 
225 aa  251  8e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
219 aa  251  8e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 
225 aa  251  8e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  53.07 
 
 
232 aa  251  9e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 
229 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  54.02 
 
 
229 aa  250  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  54.38 
 
 
221 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 
224 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.1363e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  54.88 
 
 
228 aa  249  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  54.22 
 
 
227 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.21221e-06  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  54.5 
 
 
235 aa  249  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  54.88 
 
 
228 aa  248  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  53.42 
 
 
224 aa  247  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
221 aa  247  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 
222 aa  246  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 
229 aa  246  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  49.32 
 
 
221 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 
221 aa  245  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  52.42 
 
 
229 aa  244  7e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
221 aa  244  9e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 
221 aa  243  1e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  52.68 
 
 
229 aa  244  1e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  51.98 
 
 
229 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  51.98 
 
 
229 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 
226 aa  243  2e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  51.98 
 
 
229 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  51.98 
 
 
229 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
219 aa  243  2e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
219 aa  243  2e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  52.68 
 
 
245 aa  242  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  52.05 
 
 
220 aa  242  3e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
218 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 
221 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
231 aa  241  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 
225 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  52.65 
 
 
247 aa  241  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 
221 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
231 aa  240  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 
221 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  52.91 
 
 
230 aa  239  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
221 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
231 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 
225 aa  239  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  54.75 
 
 
228 aa  239  3e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  54.5 
 
 
231 aa  239  3e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  54.75 
 
 
228 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  54.75 
 
 
228 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>