108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3205 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  84.63 
 
 
410 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
391 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  58.61 
 
 
404 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  37.76 
 
 
420 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  36.25 
 
 
420 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  35.57 
 
 
389 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  34.64 
 
 
443 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  33.91 
 
 
403 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  30.53 
 
 
403 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  38.89 
 
 
403 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  33.17 
 
 
403 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  31.22 
 
 
400 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  30.69 
 
 
400 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  29.29 
 
 
400 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  33.33 
 
 
404 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 
403 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  33.76 
 
 
406 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  32.31 
 
 
426 aa  143  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  30.37 
 
 
424 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  30.9 
 
 
405 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  34.43 
 
 
396 aa  133  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  29.38 
 
 
404 aa  126  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  34.11 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  33.12 
 
 
397 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  28.97 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  29.37 
 
 
353 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  28.43 
 
 
882 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  32.04 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  28.29 
 
 
750 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  29.02 
 
 
745 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  27.97 
 
 
745 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  27.97 
 
 
745 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.97 
 
 
745 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  27.5 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  29.32 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  29.52 
 
 
649 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  29.79 
 
 
649 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  26.92 
 
 
745 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  29.36 
 
 
649 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  33.14 
 
 
650 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  29.96 
 
 
649 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  29.36 
 
 
649 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  27.24 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  36.51 
 
 
644 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  29.07 
 
 
649 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  28.57 
 
 
575 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.87 
 
 
752 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  29.07 
 
 
649 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  29.31 
 
 
649 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  29.07 
 
 
649 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  27.17 
 
 
749 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  29.31 
 
 
649 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  27.05 
 
 
727 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26.46 
 
 
763 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26.46 
 
 
763 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  26.97 
 
 
575 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  30.61 
 
 
573 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26.46 
 
 
763 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  26.46 
 
 
766 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.46 
 
 
716 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  26.46 
 
 
844 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  30.12 
 
 
769 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.24 
 
 
769 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  28.05 
 
 
647 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  28.01 
 
 
580 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  26.82 
 
 
752 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  26.67 
 
 
555 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  27.81 
 
 
584 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  27.53 
 
 
762 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  25.2 
 
 
746 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  24.91 
 
 
756 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  29.1 
 
 
585 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  32.8 
 
 
582 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  29.79 
 
 
379 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  27.3 
 
 
572 aa  56.6  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0841  hypothetical cytosolic protein  25 
 
 
409 aa  56.2  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.37495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  30.58 
 
 
607 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  28.36 
 
 
566 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0862  hypothetical protein  27.91 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  30.58 
 
 
641 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  28.57 
 
 
590 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  27.2 
 
 
657 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  26.91 
 
 
572 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  28.43 
 
 
644 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  29.17 
 
 
630 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  27.91 
 
 
604 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  29.63 
 
 
628 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  23.66 
 
 
584 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  27.73 
 
 
630 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  28.42 
 
 
647 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  29.51 
 
 
438 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0907  protein of unknown function DUF181  27.27 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0911  protein of unknown function DUF181  27.43 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  23.64 
 
 
587 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  26.38 
 
 
635 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  24.09 
 
 
600 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  28.65 
 
 
669 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  27.05 
 
 
736 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  27.22 
 
 
466 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  26.56 
 
 
437 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>