More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3129 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 328 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  68.45 
 
 		 321 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  68.79 
 
 		 321 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  68.45 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  68.79 
 
 		 321 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  68.45 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  68.45 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  66.25 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  70.16 
 
 		 328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 326 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  66.56 
 
 		 319 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  65.18 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  64.67 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  55.24 
 
 		 317 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  50.32 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  51.76 
 
 		 327 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 		 341 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  48.77 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 319 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  47.02 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  50.94 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  47.32 
 
 		 321 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 331 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  44.75 
 
 		 336 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  45.82 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  45.91 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 321 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  47.32 
 
 		 338 aa  258  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  46.27 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  44.16 
 
 		 341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  45.69 
 
 		 319 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  44.06 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  44.17 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 329 aa  248  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  47.96 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.2 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  47.2 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  47.2 
 
 		 374 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  45.03 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  46.5 
 
 		 437 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 363 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  45.94 
 
 		 336 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  42.01 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  43.16 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  44.72 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  43.16 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  42.37 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  44.37 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  39.5 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  41.93 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  44.37 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 345 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 338 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 357 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  41.74 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>