139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3124 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 
96 aa  197  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  90.62 
 
 
96 aa  180  5e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  64.04 
 
 
95 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  59.77 
 
 
96 aa  119  1e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  60.67 
 
 
95 aa  116  1e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  60.67 
 
 
120 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  56.52 
 
 
102 aa  114  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 
113 aa  114  4e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  58.14 
 
 
111 aa  113  7e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  54.74 
 
 
125 aa  113  7e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  56.18 
 
 
95 aa  113  9e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.06 
 
 
95 aa  112  1e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  52.22 
 
 
96 aa  112  2e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  56.18 
 
 
95 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  59.55 
 
 
95 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  57.3 
 
 
100 aa  110  7e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  59.3 
 
 
95 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  52.13 
 
 
119 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  57.65 
 
 
95 aa  107  4e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  55.17 
 
 
96 aa  108  4e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  55.17 
 
 
96 aa  108  4e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  56.18 
 
 
115 aa  106  9e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  58.82 
 
 
95 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  55.81 
 
 
98 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  56.67 
 
 
97 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  53.93 
 
 
95 aa  104  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 
107 aa  104  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 
95 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  52.81 
 
 
100 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  57.47 
 
 
109 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  54.65 
 
 
104 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  52.27 
 
 
110 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  55.06 
 
 
95 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  46.74 
 
 
102 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.39 
 
 
100 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  51.69 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  51.72 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  54.65 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 
95 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  50.55 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  53.93 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  52.87 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  52.22 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  51.11 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  51.11 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  51.11 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  48.89 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  51.11 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  51.11 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  51.11 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  51.11 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  51.11 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  54.12 
 
 
118 aa  94  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  49.41 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  54.12 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  47.13 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  51.16 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  49.41 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  48.31 
 
 
98 aa  88.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  43.68 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  47.13 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  4.08802e-05  hitchhiker  5.27007e-05 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 
113 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.32 
 
 
97 aa  87  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  8.20325e-08  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  44.19 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  48.31 
 
 
95 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  48.19 
 
 
100 aa  83.2  1e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  41.38 
 
 
99 aa  83.2  1e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  54.95 
 
 
98 aa  83.2  1e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  44.32 
 
 
101 aa  82  2e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  43.53 
 
 
95 aa  80.5  8e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  42.53 
 
 
118 aa  79.7  1e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  42.53 
 
 
118 aa  79  2e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  54.55 
 
 
79 aa  79.3  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  42.53 
 
 
118 aa  79  2e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.64 
 
 
99 aa  72  2e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  52.31 
 
 
141 aa  71.2  5e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.84 
 
 
96 aa  69.7  1e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  41.67 
 
 
80 aa  63.9  8e-10  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2225  hypothetical protein  57.78 
 
 
116 aa  55.5  2e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  40.45 
 
 
104 aa  55.8  2e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  41.38 
 
 
67 aa  53.5  8e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3649  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.63 
 
 
131 aa  53.1  1e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  37.93 
 
 
96 aa  50.4  8e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.51 
 
 
104 aa  50.1  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  36.78 
 
 
97 aa  48.9  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3525  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.56 
 
 
143 aa  49.3  2e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.506874  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  30.11 
 
 
116 aa  49.3  2e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.93 
 
 
97 aa  48.5  3e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  39.76 
 
 
106 aa  48.9  3e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 
108 aa  47.8  6e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  34.88 
 
 
180 aa  47.4  6e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
117 aa  47.4  7e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  37.35 
 
 
147 aa  47  8e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  35.14 
 
 
81 aa  47  9e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.71 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4258  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00754458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3325  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.369654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.18 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.81458e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>