275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3121 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 
191 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  93.72 
 
 
191 aa  354  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  49.71 
 
 
209 aa  134  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  47.13 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  42.6 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  46.43 
 
 
197 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  50.59 
 
 
254 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  44.64 
 
 
237 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  44.64 
 
 
237 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  43.64 
 
 
196 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  41.42 
 
 
195 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  44.05 
 
 
237 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  44.05 
 
 
237 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  44.05 
 
 
237 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  55.34 
 
 
194 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
235 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  47.59 
 
 
234 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
234 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
234 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
207 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
207 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
207 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1092  PadR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
281 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0148193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  45.4 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  44.97 
 
 
287 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  45.4 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  44.31 
 
 
218 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  44.64 
 
 
219 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
226 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  40.23 
 
 
226 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  44.64 
 
 
219 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
226 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  49 
 
 
238 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  54.26 
 
 
208 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  37.71 
 
 
152 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  50.52 
 
 
201 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  51.55 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  39.52 
 
 
150 aa  99  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  55.06 
 
 
210 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  49.48 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
236 aa  94.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  44.92 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  37.28 
 
 
204 aa  91.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  45.16 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  35.47 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3926  transcriptional regulator PadR-like  36.63 
 
 
196 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  49.41 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  48.68 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  40.59 
 
 
271 aa  81.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  43.02 
 
 
277 aa  81.3  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2383  transcriptional regulator PadR-like  48.45 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  56.1 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  50 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  50 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  50 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  43.04 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  57.5 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  45.68 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  55.29 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  57.5 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  48.68 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  54.17 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  41.86 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1070  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.408045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  43.33 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.333448 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  43.33 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  51.28 
 
 
277 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  55.56 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  32.38 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  49.28 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
268 aa  72  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  45.45 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48804 
 
 
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NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  54.84 
 
 
243 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  44 
 
 
316 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  45.98 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  54.84 
 
 
247 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  46.67 
 
 
249 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802601 
 
 
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NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  44.74 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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