More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3075 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 304 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  92.76 
 
 		 304 aa  547  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  72.52 
 
 		 305 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  74 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  63.6 
 
 		 302 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  63.6 
 
 		 302 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  63.6 
 
 		 302 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  56.34 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  56.14 
 
 		 295 aa  315  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  57.51 
 
 		 295 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  59.04 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  54.14 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  58.67 
 
 		 295 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  57.78 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  57.78 
 
 		 295 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  53.31 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  52.43 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  53.56 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  55.82 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  52.63 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  50.72 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  47.92 
 
 		 302 aa  265  5.999999999999999e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  52.28 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  52.28 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  47.22 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  45.49 
 
 		 295 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  41.4 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  42.48 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  41.05 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  40.57 
 
 		 305 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  42.03 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  40 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  38.25 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  39.64 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 		 300 aa  201  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  39.31 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  40.86 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 313 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  42.7 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  43.61 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  38.6 
 
 		 330 aa  195  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  36.97 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  41.26 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  41.26 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  38.79 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  37.88 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  38.25 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 323 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 328 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  35.85 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  40.5 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  35.03 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  33.93 
 
 		 332 aa  168  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 285 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  39.11 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  34.72 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  33.1 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  34.08 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.9 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  34.39 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  32.73 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  31.94 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  33.33 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  34.4 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  36.57 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  32.22 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  33.84 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  33.84 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.94 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 		 338 aa  148  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  37.8 
 
 		 331 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  31.94 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  33.46 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  33.58 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  33.46 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  33.08 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  31.42 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  32.7 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  32.51 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>