More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3069 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  51.46 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  50.49 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  50.49 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  50.49 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  50.49 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  50.49 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  50.49 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  50.49 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  49.15 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  50.49 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  51.46 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  50.49 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  55.43 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  49.51 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  49.51 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  47.57 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  47.57 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  47.57 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  46.6 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  53.12 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  53.26 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  44.25 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  45.71 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  50.53 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  45.71 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  45.71 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  48 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  48 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  52.08 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  45.71 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  45.71 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  47 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  39.53 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  46 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  51 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  51 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  46.96 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  45.61 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  45.92 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  45.95 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  41.82 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  48.39 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  43.2 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  48.35 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  46.74 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 		 119 aa  95.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  44.94 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  48.91 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  48.91 
 
 		 206 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  48.98 
 
 		 119 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  41.75 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  48.91 
 
 		 220 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  48.91 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  48.91 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  48.91 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  46.94 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  46.94 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>