168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3022 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  92.62 
 
 
366 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  100 
 
 
366 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  68.87 
 
 
367 aa  524  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  68.22 
 
 
377 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  50.42 
 
 
363 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  49.17 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  47.93 
 
 
365 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  47.93 
 
 
365 aa  331  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  47.71 
 
 
368 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  48.17 
 
 
376 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  46.83 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  46.86 
 
 
375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  45.73 
 
 
375 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  47.37 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  47.34 
 
 
375 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  45.1 
 
 
390 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  43.3 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  46.69 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  45.81 
 
 
369 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  44.08 
 
 
367 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  43.26 
 
 
356 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  41.34 
 
 
386 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  39.15 
 
 
366 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  43.42 
 
 
353 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  43.92 
 
 
367 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  45.51 
 
 
351 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  42.7 
 
 
357 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  46.31 
 
 
361 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  43.68 
 
 
363 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  46.22 
 
 
353 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  44.76 
 
 
355 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  48.31 
 
 
351 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  41.94 
 
 
364 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  45.8 
 
 
361 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  45.38 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  41.92 
 
 
339 aa  236  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  42.73 
 
 
356 aa  235  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  39.75 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  41.11 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  41.24 
 
 
371 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  33.91 
 
 
349 aa  216  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  34.13 
 
 
449 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  36.05 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  33.72 
 
 
335 aa  205  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  39.04 
 
 
324 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  33.91 
 
 
335 aa  203  3e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  34.74 
 
 
461 aa  199  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  29.7 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  29.18 
 
 
504 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  31.15 
 
 
386 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  29.41 
 
 
393 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  32.04 
 
 
396 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.27 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  29.73 
 
 
385 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  29.92 
 
 
370 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  30.95 
 
 
387 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  29.83 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  28.49 
 
 
385 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  32.44 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  31.77 
 
 
396 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  31.77 
 
 
396 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  33.95 
 
 
391 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  29.08 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  27.22 
 
 
370 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  27.57 
 
 
370 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  29.59 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  29.17 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  27.94 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  27.57 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  27.57 
 
 
370 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  27.57 
 
 
370 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  30.65 
 
 
397 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  27.57 
 
 
368 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  29.56 
 
 
417 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  29.28 
 
 
388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  27.27 
 
 
370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  29.81 
 
 
396 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  26.1 
 
 
370 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  31.48 
 
 
424 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  32.18 
 
 
366 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  31.71 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  30.54 
 
 
396 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  30.94 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  27.24 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.37 
 
 
394 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  31.49 
 
 
397 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  31.45 
 
 
369 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  31.37 
 
 
394 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  27.52 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  25.51 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  29.36 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  30.03 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  27.96 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  28.15 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  27.73 
 
 
395 aa  109  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  25.07 
 
 
384 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  26.47 
 
 
404 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  31.61 
 
 
362 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  29.22 
 
 
393 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  30.45 
 
 
397 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>