More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2949 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
298 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  82.94 
 
 
299 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.33 
 
 
301 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  66.2 
 
 
287 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.74 
 
 
305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.74 
 
 
305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  62.75 
 
 
301 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  64.51 
 
 
309 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  59.79 
 
 
296 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  55.03 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  54.67 
 
 
310 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  54.67 
 
 
331 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  54.67 
 
 
331 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  54.7 
 
 
319 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  54.7 
 
 
319 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  55.24 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  55.4 
 
 
300 aa  271  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  52.61 
 
 
312 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  49.17 
 
 
311 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  51.22 
 
 
312 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  51.56 
 
 
268 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  51.56 
 
 
268 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  51.56 
 
 
268 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  49.15 
 
 
236 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  53.62 
 
 
294 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 
286 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.06 
 
 
299 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  34.16 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  33.8 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.13 
 
 
286 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  33.45 
 
 
302 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  33.45 
 
 
302 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  33.45 
 
 
302 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  33.1 
 
 
302 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  33.9 
 
 
299 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  33.55 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  32.41 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  33.69 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  29.97 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  30.3 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
315 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  31.14 
 
 
307 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  31.16 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  37.45 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  31.03 
 
 
304 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  31.67 
 
 
336 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 
308 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  30.46 
 
 
316 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  30.58 
 
 
320 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  34.01 
 
 
317 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  32.27 
 
 
284 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 
312 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  30.66 
 
 
302 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
308 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  30.87 
 
 
315 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  30.89 
 
 
318 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  27.71 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.32 
 
 
301 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.76 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  32.81 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  30.82 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  28.88 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  31.1 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.3 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  32.37 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.52 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27.84 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.99 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  32.1 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.55 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.19 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  26.47 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.07 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  30.3 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.48 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  29.97 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.77 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.87 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.62 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  29.97 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  29.87 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  25.44 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.21 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.07 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>