More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2836 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  100 
 
 		 156 aa  320  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  100 
 
 		 156 aa  320  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  94.12 
 
 		 154 aa  297  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  94.12 
 
 		 154 aa  297  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  53.52 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  52.82 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  53.47 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  49.35 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  54.29 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  47.4 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  51.49 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  51.02 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  45.45 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  53.62 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  46.27 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  49.23 
 
 		 152 aa  146  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  49.23 
 
 		 152 aa  146  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  44.14 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  48.46 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  44.76 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  49.26 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  46.04 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  48.15 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  38.51 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  40.41 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  38.46 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  38.46 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  37.06 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  36.92 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  36.62 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  32.85 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  32.43 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  34.03 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  31.33 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  32.87 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  30.5 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  31.01 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.97 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.2 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  32.9 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.47 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  30.71 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.33 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.04 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  33.97 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  31.43 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  30.71 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  30.71 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  30.71 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  28.08 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  31.65 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  36 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  30.87 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  35.77 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  30.66 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  29.66 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  28.08 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  28.08 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  33.11 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  30 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  30.66 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  29.63 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  30.37 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  30.72 
 
 		 187 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  34.31 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  30.71 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  28.89 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  28.89 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  28.89 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  28.89 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  28.89 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  30.71 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  32.61 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  27.52 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  28.47 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  28.47 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  32.62 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  33.11 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  32.35 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  28 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.22 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>