More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2798 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  91.55 
 
 		 578 aa  988    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  100 
 
 		 588 aa  1165    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  63.03 
 
 		 528 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  59.14 
 
 		 524 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  58.94 
 
 		 524 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  61 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  58.61 
 
 		 520 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  56.52 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  50.65 
 
 		 500 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  50 
 
 		 522 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  51.38 
 
 		 523 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  51.76 
 
 		 511 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  53.32 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  50.2 
 
 		 496 aa  477  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  50.1 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  51.17 
 
 		 516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  53.07 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  50.88 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  51.28 
 
 		 497 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  51.18 
 
 		 511 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  50.79 
 
 		 498 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  50.98 
 
 		 511 aa  465  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  52.38 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  51.79 
 
 		 498 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  51.29 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  49.1 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  49.8 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  47.98 
 
 		 501 aa  425  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  47.95 
 
 		 515 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  47.39 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  47.39 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  45.79 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  46.98 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  46.31 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  55.23 
 
 		 535 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  41.81 
 
 		 491 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  41.8 
 
 		 459 aa  357  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  41.44 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.32 
 
 		 476 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  41.13 
 
 		 513 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  41.13 
 
 		 513 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.85 
 
 		 518 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  39.51 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  42.23 
 
 		 528 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  40.85 
 
 		 523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  38.92 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  39.36 
 
 		 517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  39 
 
 		 497 aa  327  5e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  39.58 
 
 		 502 aa  327  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.34 
 
 		 464 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  39.85 
 
 		 520 aa  326  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 526 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  39.76 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  41.76 
 
 		 508 aa  323  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  39.07 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  40.36 
 
 		 527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.61 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.33 
 
 		 466 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.89 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  38.69 
 
 		 483 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  43.46 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.25 
 
 		 464 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  39.62 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  39.4 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  38.72 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  41.9 
 
 		 503 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  41.9 
 
 		 503 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  38.77 
 
 		 520 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  40.13 
 
 		 509 aa  316  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  39.22 
 
 		 523 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  39.73 
 
 		 504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  39.04 
 
 		 528 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.25 
 
 		 473 aa  312  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  42.99 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.65 
 
 		 474 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  39.08 
 
 		 516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.41 
 
 		 485 aa  310  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  39.66 
 
 		 527 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  39.11 
 
 		 476 aa  309  9e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  37.96 
 
 		 527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.22 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  38.61 
 
 		 475 aa  307  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.6 
 
 		 482 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  46.44 
 
 		 483 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  39.78 
 
 		 473 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  38.92 
 
 		 481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.4 
 
 		 474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  49.57 
 
 		 458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  37.57 
 
 		 485 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  37.05 
 
 		 491 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  41.06 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  38.65 
 
 		 501 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  38.44 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.71 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  39.19 
 
 		 477 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  37.83 
 
 		 475 aa  298  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.25 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.04 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  40.54 
 
 		 480 aa  297  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  39.35 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>