103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2725 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  100 
 
 
271 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  89.67 
 
 
271 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  72.53 
 
 
276 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  71.59 
 
 
273 aa  384  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  69.74 
 
 
272 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  70.7 
 
 
276 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  68.86 
 
 
276 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  67.9 
 
 
276 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  68.75 
 
 
272 aa  367  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 
276 aa  359  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  65.93 
 
 
276 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  65.17 
 
 
276 aa  343  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  65.09 
 
 
277 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  64.79 
 
 
276 aa  339  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  60 
 
 
281 aa  303  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  60 
 
 
281 aa  303  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  60.22 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  42.7 
 
 
297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  57.24 
 
 
152 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  51.95 
 
 
182 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  56.03 
 
 
143 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  50.99 
 
 
157 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  50.99 
 
 
157 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  50.33 
 
 
157 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  58.52 
 
 
205 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  58.52 
 
 
205 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  58.52 
 
 
205 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  58.52 
 
 
205 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  58.52 
 
 
205 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  52.05 
 
 
152 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  58.52 
 
 
142 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  58.52 
 
 
142 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  51.39 
 
 
150 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  50.7 
 
 
288 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  52.21 
 
 
140 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  48.95 
 
 
155 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  48.67 
 
 
156 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  48.59 
 
 
287 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  55.56 
 
 
128 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.55 
 
 
285 aa  131  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  43.38 
 
 
144 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  35.66 
 
 
146 aa  96.3  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  33.67 
 
 
363 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  37.5 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  32.18 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  38.31 
 
 
331 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  38.31 
 
 
273 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  38.31 
 
 
325 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  38.31 
 
 
303 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  38.31 
 
 
303 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  38.31 
 
 
325 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  38.46 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  37.66 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  36.09 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  34.18 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  34.56 
 
 
316 aa  79  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  32.69 
 
 
313 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  37.5 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  39.13 
 
 
141 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  32.69 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  37.41 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  32.9 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  38.03 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  36.05 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  38.03 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  38.03 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  33.33 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  35.04 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  38.64 
 
 
320 aa  72  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  32.72 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  36.36 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  38.64 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  36.36 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  36.03 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  35.86 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  34.67 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  34.67 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  35.61 
 
 
323 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  53.85 
 
 
93 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  38.1 
 
 
113 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
106 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  32 
 
 
125 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  36 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  36.84 
 
 
305 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  31 
 
 
102 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  34.65 
 
 
379 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
185 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
325 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
325 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
101 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
102 aa  45.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  35.8 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
108 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
108 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
108 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
108 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
108 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
101 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
101 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>