More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2702 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  88.89 
 
 
657 aa  1135    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  60.69 
 
 
650 aa  709    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 
656 aa  1322    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 
744 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.93 
 
 
754 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  32.81 
 
 
760 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  32.53 
 
 
756 aa  262  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.42 
 
 
696 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  32.88 
 
 
759 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  30.14 
 
 
746 aa  247  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
701 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.33 
 
 
694 aa  242  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  33.97 
 
 
670 aa  240  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.33 
 
 
764 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.42 
 
 
614 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  38.75 
 
 
734 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
752 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  33.87 
 
 
729 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.3 
 
 
753 aa  223  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  30.07 
 
 
638 aa  223  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 
696 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  31.64 
 
 
794 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.62 
 
 
656 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.39 
 
 
658 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.56 
 
 
737 aa  211  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.55 
 
 
703 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.1 
 
 
758 aa  200  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 
607 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
667 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.22 
 
 
701 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.16 
 
 
723 aa  194  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  41.39 
 
 
741 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  38.4 
 
 
717 aa  190  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.38 
 
 
758 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  31.97 
 
 
758 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  34.07 
 
 
725 aa  188  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.24 
 
 
597 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.65 
 
 
672 aa  188  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  32.19 
 
 
758 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.52 
 
 
611 aa  187  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.93 
 
 
723 aa  187  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.5 
 
 
936 aa  185  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  28.09 
 
 
744 aa  184  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  37.59 
 
 
702 aa  184  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 
645 aa  178  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26.02 
 
 
641 aa  176  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 
665 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 
641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  32.83 
 
 
675 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 
735 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  31.59 
 
 
731 aa  172  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.83 
 
 
650 aa  171  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  34.7 
 
 
864 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  27.08 
 
 
632 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.6 
 
 
701 aa  167  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
861 aa  167  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  38.36 
 
 
712 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  34.22 
 
 
701 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.75 
 
 
761 aa  164  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  35.78 
 
 
860 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  26.25 
 
 
738 aa  161  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.48 
 
 
757 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  38.85 
 
 
903 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 
681 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  27.69 
 
 
582 aa  160  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  38.25 
 
 
699 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 
911 aa  153  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  37.17 
 
 
724 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  34.76 
 
 
859 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  24.89 
 
 
643 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  34.05 
 
 
636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  31.56 
 
 
753 aa  150  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.91 
 
 
858 aa  148  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  34.66 
 
 
593 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.53 
 
 
637 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  33.21 
 
 
713 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  30.02 
 
 
632 aa  144  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.21 
 
 
1207 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.19 
 
 
797 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  33.75 
 
 
536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  31.69 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  31.55 
 
 
487 aa  142  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  33.64 
 
 
726 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  35.47 
 
 
284 aa  140  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  36.13 
 
 
446 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  36.84 
 
 
431 aa  140  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  24.81 
 
 
721 aa  140  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  37.28 
 
 
441 aa  140  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  33.05 
 
 
483 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  32.64 
 
 
483 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
577 aa  138  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.96 
 
 
643 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.92 
 
 
483 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  31.47 
 
 
479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  34.06 
 
 
523 aa  137  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 
643 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.58 
 
 
652 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  33.08 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  40.22 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  32.14 
 
 
513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>