63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2681 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  84.58 
 
 		 216 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  36.65 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  38.51 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  36.41 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.1 
 
 		 243 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  34.04 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  55.17 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  32.83 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.85 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  33.84 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  33.51 
 
 		 180 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.63 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  35.17 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  33.33 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  32.31 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  36.2 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  34.64 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  27.57 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  30.98 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  33.33 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  30.22 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  28.67 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  31.97 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  34.9 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  41.94 
 
 		 114 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2815  ArsR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.897524  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 102 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  39.47 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 117 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  51.16 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0361  hypothetical protein  31.65 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  44.83 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 120 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  38.98 
 
 		 210 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  40.68 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 		 472 aa  42  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 		 112 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 240 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 		 120 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>