More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2666 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  91.5 
 
 
564 aa  1058    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  100 
 
 
586 aa  1202    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.41 
 
 
511 aa  296  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.41 
 
 
510 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0595  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.45 
 
 
730 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
535 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  41.95 
 
 
535 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3985  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.31 
 
 
730 aa  166  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.86 
 
 
531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
463 aa  160  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1496  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.67 
 
 
741 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
816 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
405 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  36.82 
 
 
496 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  37.94 
 
 
529 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
644 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
679 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  35.45 
 
 
696 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
646 aa  147  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
728 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
387 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
643 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
581 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
1066 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
1516 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
815 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
884 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
646 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  34.14 
 
 
648 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
701 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
1383 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
1138 aa  141  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  34.5 
 
 
689 aa  141  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
421 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
639 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
639 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
641 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
1259 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
474 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
342 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
1484 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
418 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
958 aa  137  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
389 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
389 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
930 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2539  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.787523  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
714 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  35.38 
 
 
698 aa  134  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
386 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
456 aa  134  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  30.24 
 
 
1340 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
763 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
874 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  30.52 
 
 
1400 aa  133  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
708 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
718 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
1043 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
607 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
763 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
763 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
614 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
770 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
1010 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
695 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  30.77 
 
 
614 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
592 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  33.48 
 
 
1384 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
372 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00620911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  31.62 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
3470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1659  histidine kinase  33.78 
 
 
594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
763 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
676 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
686 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
1258 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
549 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
528 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
1711 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
487 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
543 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
1406 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
1039 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
470 aa  127  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
716 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
1741 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>