More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2636 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  55.5 
 
 		 214 aa  221  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  44.22 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  34.87 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 195 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  31.84 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 244 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  31.07 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  33 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  32.69 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 251 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.35 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  34.59 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  25.76 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  30.48 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  30.54 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>