More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2582 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  92.61 
 
 
232 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  58.77 
 
 
235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  56.82 
 
 
229 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  57.73 
 
 
229 aa  267  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  57.73 
 
 
231 aa  266  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 
231 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  54.87 
 
 
229 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  55.86 
 
 
230 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  53.91 
 
 
232 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  55.75 
 
 
229 aa  262  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  55 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  55.56 
 
 
235 aa  258  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  54.3 
 
 
235 aa  254  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 
231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  53.81 
 
 
268 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  55.7 
 
 
232 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  53.57 
 
 
228 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  55.26 
 
 
232 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  54.63 
 
 
230 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  55.26 
 
 
232 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  52.38 
 
 
231 aa  243  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  54.39 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  53.95 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  54.82 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  53.95 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  49.09 
 
 
225 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
240 aa  236  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  53.98 
 
 
241 aa  230  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  49.08 
 
 
232 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 
221 aa  201  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  46.15 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.91 
 
 
240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  42.11 
 
 
238 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  45 
 
 
235 aa  198  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  42.33 
 
 
232 aa  198  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.83 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.52 
 
 
225 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  46.43 
 
 
255 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
248 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  41.26 
 
 
248 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 
254 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  42.41 
 
 
238 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  43.81 
 
 
252 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  41.59 
 
 
235 aa  193  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.36 
 
 
226 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  41.89 
 
 
228 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
255 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  41.78 
 
 
237 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  44.64 
 
 
236 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 
224 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 
224 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
224 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
224 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  43.11 
 
 
226 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
224 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
224 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
224 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  43.56 
 
 
226 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1310  ABC transporter related  45.49 
 
 
248 aa  191  7e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 
224 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 
224 aa  191  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 
228 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  42.15 
 
 
224 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  44.75 
 
 
222 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  45.13 
 
 
238 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  44.55 
 
 
235 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  43.17 
 
 
233 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  46.04 
 
 
230 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 
233 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45 
 
 
226 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  41.63 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  43.72 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  42.41 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  48.17 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  43.67 
 
 
240 aa  188  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.45 
 
 
237 aa  188  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 
224 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 
256 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 
256 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 
256 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  42.53 
 
 
226 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  40.36 
 
 
229 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  42.65 
 
 
230 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  47.03 
 
 
242 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  40.89 
 
 
298 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 
256 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 
256 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 
256 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>