154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2580 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
400 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  79.37 
 
 
402 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  40 
 
 
396 aa  272  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  41.37 
 
 
393 aa  272  9e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  38.27 
 
 
396 aa  202  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  36.62 
 
 
440 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  36.36 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  32.99 
 
 
388 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  33.76 
 
 
388 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  33.5 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  33.5 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  33.25 
 
 
388 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  33.25 
 
 
388 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.99 
 
 
388 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  32.74 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  32.74 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  34.6 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.98 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  32.74 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  31.22 
 
 
388 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  31.77 
 
 
388 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  32.9 
 
 
388 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  33.08 
 
 
389 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  31.27 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  32.03 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 
387 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 
391 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  31.51 
 
 
388 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  26 
 
 
454 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.41 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  27.38 
 
 
386 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 
406 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.49 
 
 
642 aa  55.8  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.57 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 
844 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.47 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.71 
 
 
413 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.34 
 
 
642 aa  53.9  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.82 
 
 
390 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
409 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  30.46 
 
 
391 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  30.46 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  30.46 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  30.46 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  30.46 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
383 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
383 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
384 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
391 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  27.59 
 
 
646 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  22.22 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  25.27 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  27.5 
 
 
412 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  26.35 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  28.41 
 
 
861 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.52 
 
 
648 aa  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.29 
 
 
640 aa  50.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.86 
 
 
842 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25 
 
 
652 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.71 
 
 
696 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  23.47 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.66 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  24.37 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.55 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  25.1 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  28.1 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.03 
 
 
414 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  23.43 
 
 
414 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.27 
 
 
412 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 
417 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.5 
 
 
649 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
475 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
475 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
475 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
475 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 
401 aa  46.6  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  28.4 
 
 
393 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  28.37 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.43 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.75 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  23.74 
 
 
641 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  29.93 
 
 
857 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.33 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  30.54 
 
 
475 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  26.57 
 
 
648 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.5 
 
 
649 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  26.57 
 
 
648 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.95 
 
 
653 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>