More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2450 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  100 
 
 
409 aa  819    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  71.88 
 
 
407 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  35.29 
 
 
237 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  38.17 
 
 
242 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  45.64 
 
 
151 aa  122  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  36.49 
 
 
243 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  45.21 
 
 
153 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  36.74 
 
 
230 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  46.21 
 
 
154 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  43.45 
 
 
153 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 
155 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  41.78 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  38.89 
 
 
236 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  41.1 
 
 
153 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  49.65 
 
 
151 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  41.26 
 
 
152 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  50.34 
 
 
152 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  32.16 
 
 
229 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 
155 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  44.06 
 
 
153 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  34.72 
 
 
156 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  42.55 
 
 
152 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  43.06 
 
 
151 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  36.62 
 
 
236 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  36.62 
 
 
236 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  42.47 
 
 
162 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 
155 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  42.47 
 
 
162 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  42.47 
 
 
162 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  36.24 
 
 
231 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  37.41 
 
 
158 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 
154 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  47.92 
 
 
152 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  41.84 
 
 
155 aa  106  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 
153 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 
157 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  35.94 
 
 
236 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 
154 aa  106  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  38.3 
 
 
151 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 
157 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 
154 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 
157 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 
154 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 
168 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  46.41 
 
 
167 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  32.78 
 
 
264 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
155 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  44.2 
 
 
152 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  40.69 
 
 
155 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  39.63 
 
 
177 aa  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 
157 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 
154 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 
163 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 
153 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  40.69 
 
 
155 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
162 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  45.21 
 
 
156 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 
156 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 
154 aa  101  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 
155 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
157 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  34.91 
 
 
250 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 
154 aa  99.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 
154 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  29.58 
 
 
238 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
156 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 
155 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  32.31 
 
 
254 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 
156 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  40.69 
 
 
152 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 
160 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  34.68 
 
 
255 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  35.71 
 
 
170 aa  97.8  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  34.69 
 
 
154 aa  97.8  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  27.91 
 
 
241 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 
162 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  31.69 
 
 
240 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  29.11 
 
 
241 aa  97.1  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  34.69 
 
 
154 aa  97.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 
153 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  35.05 
 
 
233 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 
157 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 
155 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  35.67 
 
 
164 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  33.33 
 
 
298 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  43.08 
 
 
144 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  40.97 
 
 
153 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  35.76 
 
 
154 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 
153 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 
155 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  35.4 
 
 
164 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 
155 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 
160 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  34.45 
 
 
264 aa  95.5  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 
156 aa  94.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  32.02 
 
 
269 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  42.31 
 
 
144 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 
153 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  38.69 
 
 
153 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>