241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2426 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  69.84 
 
 		 443 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  73.08 
 
 		 443 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  72.4 
 
 		 443 aa  663    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 441 aa  910    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  42.69 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 536 aa  97.8  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 610 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.56 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1742  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.4 
 
 		 590 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.56 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1367  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 595 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.94 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0100  hypothetical protein  23.76 
 
 		 574 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0356789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  24.04 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2264  extracellular solute-binding protein, family 1  23.62 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.864304  decreased coverage  0.00109234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1898  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.477877  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1738  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217891 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  24.38 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2909  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3473  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.971584  hitchhiker  0.00076059 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2089  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115344  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 574 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2416  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000012875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1597  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 573 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3982  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.227864  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.83 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4211  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4889  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  23.96 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1445  extracellular solute-binding protein family 1  22.5 
 
 		 579 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2047  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 580 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120072  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5977  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  22.5 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.34 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2227  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  24.5 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272484  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4098  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 569 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00991271  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1969  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 588 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3333  conserved hypothetical signal peptide protein  23.74 
 
 		 578 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2095  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.91 
 
 		 569 aa  77  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.105917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4063  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 599 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.159076  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.44 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3169  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  22.79 
 
 		 573 aa  76.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000122164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3630  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 580 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2986  putative signal peptide protein  23.58 
 
 		 581 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2670  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00030492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6464  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  22.27 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3051  putative signal peptide protein  23.52 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0886733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5372  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.737373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1201  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 572 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487559  normal  0.842714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2229  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 580 aa  70.1  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0301867  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.92 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.92 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3671  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 577 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00462233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009831  Ssed_1918  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.9 
 
 		 573 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000332483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0381  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000205955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6724  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1030  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2204  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 579 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0389  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 577 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.83487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2375  transporter, putative  24.93 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.229304 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.05 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.92 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 488 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0609  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 577 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2317  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000660046  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3391  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 577 aa  63.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>