10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2396 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2396  putative transmembrane protein  100 
 
 		 342 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296923  decreased coverage  0.00231835 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5667  putative transmembrane protein  69.12 
 
 		 342 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1905  membrane protein  23.92 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0451788  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6453  membrane protein  26.79 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0252  hypothetical protein  23.03 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4466  membrane protein  27.67 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1738  hypothetical protein  25.8 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0751  hypothetical protein  28.23 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.890953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2744  hypothetical protein  29.09 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2822  hypothetical protein  29.09 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>