More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2380 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2380  gluconate 5-dehydrogenase  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667021  decreased coverage  0.0022048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2136  gluconate 5-dehydrogenase  90.62 
 
 
256 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510387  normal  0.0477177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5878  gluconate 5-dehydrogenase  50.61 
 
 
259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854497  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0468  gluconate 5-dehydrogenase  51.42 
 
 
251 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2747  gluconate 5-dehydrogenase  56.1 
 
 
253 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
272 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  42.8 
 
 
257 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  40.73 
 
 
254 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
274 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
256 aa  201  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  43.2 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  39.92 
 
 
258 aa  198  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  39.92 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
257 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  42.69 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
257 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  41.02 
 
 
256 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
257 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
257 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  41.9 
 
 
251 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
257 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
269 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
260 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
255 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  40.08 
 
 
254 aa  188  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0620  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
255 aa  188  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  39.52 
 
 
254 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.37 
 
 
257 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  39.84 
 
 
255 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
255 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
254 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5798  gluconate 5-dehydrogenase  40.8 
 
 
251 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  hitchhiker  0.00243591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
261 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4887  gluconate 5-dehydrogenase  38 
 
 
254 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
256 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  38 
 
 
254 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
254 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  36.69 
 
 
289 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  38 
 
 
254 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  36.69 
 
 
254 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  38 
 
 
254 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  36.69 
 
 
254 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4738  gluconate 5-dehydrogenase  38 
 
 
254 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4768  gluconate 5-dehydrogenase  38 
 
 
254 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136475  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4831  gluconate 5-dehydrogenase  38 
 
 
254 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
256 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  37.6 
 
 
254 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  35.97 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4868  gluconate 5-dehydrogenase  37.5 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.113188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
253 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
255 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.808003  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  35.97 
 
 
262 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  36.69 
 
 
263 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.15 
 
 
255 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
257 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
256 aa  165  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  37.5 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
252 aa  162  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
255 aa  161  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.966986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
255 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
254 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
265 aa  158  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7371  short-chain alcohol dehydrogenase  43.72 
 
 
254 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
254 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
257 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.29 
 
 
248 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.85 
 
 
256 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.45 
 
 
258 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
254 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
256 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.936397  normal  0.224474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.83 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2646  phosphatidylserine decarboxylase  37.35 
 
 
258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229989  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.04 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0672528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4949  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
255 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220607  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
263 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
259 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0536617  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
257 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
260 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
262 aa  151  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
251 aa  151  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4264  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.55 
 
 
255 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
259 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  37.88 
 
 
259 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 
254 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  33.07 
 
 
270 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  37.96 
 
 
254 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
255 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 
247 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4030  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.4 
 
 
261 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.721493  normal  0.432125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.96 
 
 
251 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
259 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.49 
 
 
246 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
251 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
256 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
256 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
254 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>