93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2379 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 377 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 385 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 385 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 378 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  24.49 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  26.2 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  22.66 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  28.18 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  24.24 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  20.98 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5514  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  25.59 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  25.42 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 191 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  32.76 
 
 		 275 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  25.32 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  25.81 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 367 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  38.04 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2324  DNA-binding response regulator  37.74 
 
 		 217 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1034  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 180 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  28.7 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  24.37 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  43.14 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3086  LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  27.52 
 
 		 370 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 486 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0653  LuxR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 206 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.203226 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 209 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0795  regulatory protein LuxR  37.04 
 
 		 202 aa  46.2  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000492678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  18.81 
 
 		 374 aa  46.2  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.89 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  40.68 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  31.15 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  23.7 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  26.23 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  27.87 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 948 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 151 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 586 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.72 
 
 		 258 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3630  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 588 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1867  two component LuxR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00198288  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1682  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 187 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 221 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  26.29 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  25.25 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  30 
 
 		 209 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>