More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2316 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  100 
 
 
511 aa  1046    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  66.73 
 
 
511 aa  716    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.97 
 
 
511 aa  696    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  96.09 
 
 
511 aa  988    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.29 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  49.07 
 
 
513 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
536 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.95 
 
 
512 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.8 
 
 
513 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  47.81 
 
 
513 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  47.81 
 
 
513 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
511 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 
536 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.29 
 
 
531 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 
530 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.4 
 
 
533 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.73 
 
 
530 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  45.64 
 
 
532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
518 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
594 aa  359  7e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 
509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
523 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 
717 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
798 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 
617 aa  220  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48.8 
 
 
620 aa  216  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 
600 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 
836 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
1138 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
773 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
502 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
704 aa  206  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 
389 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.73 
 
 
844 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
728 aa  203  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
784 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
484 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 
769 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 
1192 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  38.89 
 
 
783 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  38.89 
 
 
783 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  42.17 
 
 
1035 aa  200  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 
770 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
1276 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
1296 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  39.31 
 
 
790 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  41.77 
 
 
1035 aa  197  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  40.65 
 
 
470 aa  195  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  40.57 
 
 
1410 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
1055 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
969 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 
911 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
769 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
468 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
769 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
377 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
778 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  41.94 
 
 
470 aa  192  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
772 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
606 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3322  histidine kinase  43.83 
 
 
278 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  43.55 
 
 
773 aa  191  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
605 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  40.91 
 
 
771 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
1000 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  42.45 
 
 
771 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  39.92 
 
 
503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  41.63 
 
 
774 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
614 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
562 aa  183  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
587 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
605 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 
643 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
774 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  40.83 
 
 
648 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
494 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  41.99 
 
 
599 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
764 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
583 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
646 aa  178  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
676 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
775 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
513 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
782 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1284  sensor histidine kinase  37.34 
 
 
475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
786 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
779 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  40.34 
 
 
288 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
569 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
775 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
630 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  39.91 
 
 
525 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  37.41 
 
 
786 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0003  sensor histidine kinase  40.83 
 
 
447 aa  170  7e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0648198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
786 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
612 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
614 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 
686 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
627 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
700 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>