124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2315 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  84.32 
 
 		 185 aa  270  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  45.35 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  35.85 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  37.57 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  45.38 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  45.38 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  45.73 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  41.33 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  41.82 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  41.86 
 
 		 214 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  42.64 
 
 		 226 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  45.16 
 
 		 214 aa  94.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  45.97 
 
 		 227 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  36.91 
 
 		 220 aa  94.4  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  45.97 
 
 		 227 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  45.16 
 
 		 227 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  40 
 
 		 534 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  38.57 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  39.47 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  46.46 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  37.18 
 
 		 241 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  36.13 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  38.1 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  37.14 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  40.32 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  35.92 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  37.96 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  36.03 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  34.81 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  33.97 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.89 
 
 		 158 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.57 
 
 		 226 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  36 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  33.12 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  37.74 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  33.99 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  37.19 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  38.71 
 
 		 243 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  35.82 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  35.16 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  38.76 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  34.13 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  37.4 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  28.85 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  35.34 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  37.21 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  33.13 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  40.87 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.37 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.38 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  29.32 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  35.58 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.93 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  33.58 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.74 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.74 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  26.74 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.08 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  32.54 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  37.98 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  29.68 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.45 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  28.37 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.82 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  26.9 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.23 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.74 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  35.94 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  37.29 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  31.75 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.48 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.33 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  30.63 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  32.8 
 
 		 282 aa  51.2  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.56 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  34.4 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  29.22 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  31.09 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  34.13 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  31.03 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  29.3 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  30.99 
 
 		 272 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  30.82 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  29.2 
 
 		 276 aa  47.8  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  28.91 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  30.26 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  30.53 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  30.11 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  25.81 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  28.44 
 
 		 131 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.38 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  26.98 
 
 		 247 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  27.59 
 
 		 286 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  25.42 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>