More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2294 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  100 
 
 
272 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  93.38 
 
 
272 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  72.96 
 
 
274 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  74.58 
 
 
241 aa  348  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  59.7 
 
 
276 aa  318  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  58.65 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  58.89 
 
 
255 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  38.55 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  40.73 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  38.89 
 
 
312 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  37.97 
 
 
311 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  36.15 
 
 
338 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  36.23 
 
 
310 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  35.57 
 
 
308 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  35.82 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  36.8 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  38.4 
 
 
330 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  35.06 
 
 
308 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  34.68 
 
 
456 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  31.47 
 
 
561 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  31.47 
 
 
561 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  32.72 
 
 
447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  32.83 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  36.21 
 
 
331 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  32.46 
 
 
577 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  31.42 
 
 
577 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  35.12 
 
 
331 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  35.32 
 
 
439 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  39.09 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  33.6 
 
 
436 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 
444 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  35.36 
 
 
308 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  34.7 
 
 
436 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 
436 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  28.92 
 
 
417 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  29.96 
 
 
456 aa  99.8  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  33.2 
 
 
438 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 
358 aa  65.9  0.0000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 
356 aa  65.5  0.0000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 
485 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
203 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 
447 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  25.39 
 
 
219 aa  55.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  32 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  43.59 
 
 
225 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  23.59 
 
 
210 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  32.32 
 
 
354 aa  52.8  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
265 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  27.17 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 
243 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  28.68 
 
 
246 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 
234 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.77 
 
 
672 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  31.78 
 
 
263 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  40.24 
 
 
210 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.01 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.13 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.67 
 
 
422 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.54 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
207 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.45 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  34.17 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.31 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.76 
 
 
415 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  28.7 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  25.81 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  33.01 
 
 
292 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  33.04 
 
 
308 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
241 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.31 
 
 
238 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  26.59 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.31 
 
 
236 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1042  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 
195 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  28.48 
 
 
291 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  33.91 
 
 
275 aa  49.3  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
269 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>