269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2286 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  74.59 
 
 		 486 aa  758    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 484 aa  996    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7356  ABC transporter, binding protein  30.04 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2118  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6392  extracellular solute-binding protein family 1  30.04 
 
 		 546 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 428 aa  113  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  25.58 
 
 		 484 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 513 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.92 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.92 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 447 aa  97.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 536 aa  95.1  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  24.77 
 
 		 450 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 450 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 450 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 458 aa  87  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 428 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2229  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 580 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0301867  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3630  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 580 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3391  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2317  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000660046  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0381  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000205955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6724  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 580 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3333  conserved hypothetical signal peptide protein  24.21 
 
 		 578 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5372  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 580 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.737373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2089  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 593 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0389  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.83487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3671  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00462233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3051  putative signal peptide protein  25.49 
 
 		 580 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0886733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0483  twin-arginine translocation pathway signal  25.21 
 
 		 579 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2986  putative signal peptide protein  24.46 
 
 		 581 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2204  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 579 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.24 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.94 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1030  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 577 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3169  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  25.34 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000122164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.77 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2663  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1445  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 579 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5977  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.79 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4889  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  24.1 
 
 		 596 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2264  extracellular solute-binding protein, family 1  23.91 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.864304  decreased coverage  0.00109234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4211  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 598 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3473  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.971584  hitchhiker  0.00076059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1898  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.477877  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1738  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1742  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.95 
 
 		 590 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1321  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 574 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00160153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6464  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.5 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0609  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 610 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  24.93 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2416  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000012875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4387  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  23.33 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3127  sugar ABC transporter  26.07 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1367  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4063  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 599 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.159076  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 574 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2539  putative ABC transporter, substrate binding protein  23.2 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5596  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198436  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3982  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 573 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.227864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2227  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  23.36 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272484  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.07 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  20.74 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>