More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2283 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  100 
 
 		 310 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  77.85 
 
 		 308 aa  474  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  63.93 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  57.98 
 
 		 307 aa  355  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7825  putative ribokinase  64.26 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  58.28 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  54.28 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4655  ribokinase  57.57 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.557505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1401  ribokinase  57.62 
 
 		 325 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033164  normal  0.166986 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1272  putative ribokinase  57.14 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0725613 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  40.86 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  41.94 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  40.2 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  40.2 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  40.4 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  41.25 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  40.52 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  38.74 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  37.25 
 
 		 404 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.46 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  38.85 
 
 		 424 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  41.47 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  39.07 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  37.46 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  38.74 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  38.36 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.76 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  35.2 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  39.1 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.25 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  35.2 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  37.83 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  35.2 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  35.2 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  35.2 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  39.14 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  36.27 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  41.25 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  36.27 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  36.27 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41.25 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  41.25 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  36.27 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  41.2 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  38.18 
 
 		 403 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  38.51 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  40.92 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  35.95 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.85 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.56 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  35.81 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  38.76 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  38.76 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  36.75 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.21 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.97 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34.3 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.58 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  40.07 
 
 		 314 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  39.74 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  39.74 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  41.33 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  37.79 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  38.82 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  31.8 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  39.74 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  39.74 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  39.74 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  38.72 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  38.08 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.12 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  40.67 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  37.83 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  33.98 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  37.79 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  39.74 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  35.45 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  40.67 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  32.13 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  37.21 
 
 		 305 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  37.74 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  37.58 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  38.08 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  38.36 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  36.72 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  36.12 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  31.59 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  36.12 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  37.33 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  38.87 
 
 		 312 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  37.33 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  35.88 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  34.64 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  39.6 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  37.01 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  34.64 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  37.3 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>