226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2252 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 316 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  96.52 
 
 		 316 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  75.16 
 
 		 316 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  45.57 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  42.09 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 314 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  38.26 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  39.35 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  36.59 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  32.57 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  32.57 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.57 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.24 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.24 
 
 		 315 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  32.24 
 
 		 315 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.24 
 
 		 315 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.04 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.24 
 
 		 315 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  30.79 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  28.44 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  30.7 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  31.13 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  27.01 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  32.9 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  29.75 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  30.5 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.87 
 
 		 694 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  30.5 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  28.39 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  28.39 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  30.19 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  28.08 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  24.84 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  30.55 
 
 		 694 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  30.13 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  31.72 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  31.72 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  31.72 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  31.72 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  31.72 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  31.72 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  30.57 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  30.32 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  30.32 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  30.32 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  30.32 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  30.32 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  26.89 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  30.16 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  30.16 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  28.94 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  30.16 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  30.16 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  27.42 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  26.86 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  29.07 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  28.06 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  26.64 
 
 		 700 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  29.81 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  28.03 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  28.85 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  31.41 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>