70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2243 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  86.5 
 
 
326 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  52.56 
 
 
305 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  42.71 
 
 
301 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  28.32 
 
 
288 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  29.62 
 
 
287 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  29.55 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  32.78 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  31.4 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.77 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.72 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  26.32 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  27.17 
 
 
288 aa  89.4  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  27.56 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  26.16 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  33.04 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  28.97 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  35.68 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  30.3 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  28.77 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  28.37 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  30.29 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  31.93 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  30.74 
 
 
277 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  31.93 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  34.07 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  34.4 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  26.71 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  30.97 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  30.22 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  29.41 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.6 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  33.66 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  30.56 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  29.37 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  28.71 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  26.64 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  29.97 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  23.7 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  30.32 
 
 
151 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  34.33 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
240 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  26.57 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  27.43 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  21.65 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  35.42 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  29.38 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  25.58 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  32.95 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  20.98 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  26.59 
 
 
319 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  25.28 
 
 
300 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  26.56 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2293  hypothetical protein  34.44 
 
 
222 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.661266  normal  0.0651715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  27.46 
 
 
251 aa  46.2  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  31.85 
 
 
408 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  25 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  25.6 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  34.06 
 
 
498 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
248 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  35.24 
 
 
286 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
381 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
257 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  32.46 
 
 
359 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>