More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2230 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  100 
 
 
98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  74.19 
 
 
94 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  57.45 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  54.26 
 
 
94 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  56.58 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  57.14 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  51.32 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  43.68 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  52.7 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  45.78 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  40.43 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  44.19 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  52.56 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  43.68 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  44.16 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  50.68 
 
 
99 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  43.75 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  47.5 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  46.15 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  52.05 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  48.89 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  46.38 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  45.33 
 
 
100 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  40.22 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  52.94 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  42.11 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  37.93 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  49.35 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  38.2 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  48.61 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  41.98 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  40.91 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  50.77 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  39.29 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  49.38 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  46.74 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  37.65 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  44.19 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  44.58 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  38.55 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  35.63 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  44.58 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  38.2 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  41.38 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  41.67 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  48.05 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  43.68 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  46.58 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  43.68 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  42.68 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  42.68 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  42.68 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  42.68 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  42.68 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  42.68 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  42.5 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  43.42 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  38.3 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  39.53 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0918  acylphosphatase  50 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  48.57 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  48.57 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  40.51 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  42.35 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  40.51 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  47.56 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  41.46 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  44.3 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  38.3 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  45.83 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  39.51 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  47.06 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  48.1 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  40.28 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  40.51 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  41.98 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  40.23 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  43.9 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  43.9 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  40.23 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  40.91 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  41.46 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  41.56 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  41.46 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  45.57 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  41.46 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  41.46 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  41.46 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  46.84 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  37.08 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  38.71 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  37.5 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  41.56 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  41.18 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  47.83 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  43.33 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  46.15 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  36.96 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  47.83 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>