More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2213 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 515 aa  1011    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  63.67 
 
 		 512 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  62.48 
 
 		 574 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  63.17 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  63.37 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  64.01 
 
 		 543 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  63.37 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  63.37 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  62.85 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  63.05 
 
 		 512 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  60.8 
 
 		 505 aa  569  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  63.86 
 
 		 521 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  63.06 
 
 		 529 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  58.68 
 
 		 522 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  52.75 
 
 		 500 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  58.1 
 
 		 506 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 		 522 aa  234  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.26 
 
 		 516 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 511 aa  223  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.2 
 
 		 469 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.5 
 
 		 522 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 510 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 478 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 484 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  33.33 
 
 		 582 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.92 
 
 		 478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 519 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 587 aa  196  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.54 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  31.9 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 489 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 516 aa  192  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  190  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  190  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 521 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 		 458 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 		 478 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 513 aa  180  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 514 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  30.45 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.14 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.98 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 		 508 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.81 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 		 488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.33 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.79 
 
 		 510 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.56 
 
 		 471 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.58 
 
 		 467 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 509 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 502 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.21 
 
 		 458 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.29 
 
 		 498 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 470 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.15 
 
 		 478 aa  163  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.26 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 539 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.21 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 519 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 509 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 500 aa  159  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 538 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  30.1 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 584 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 523 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 500 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.7 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 546 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 500 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 499 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>