30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2174 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2174  putative FHA domain containing protein  100 
 
 
351 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00685953  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1962  hypothetical protein  80.11 
 
 
355 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173944  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  76.34 
 
 
490 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  58.96 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  40.23 
 
 
425 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  47.01 
 
 
415 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  51.92 
 
 
410 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  47.92 
 
 
564 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  57.58 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  37.37 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  39.13 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  39.08 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  46.58 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  62.5 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  37.23 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  38.51 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  36.08 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  52.94 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  37.21 
 
 
462 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  57.14 
 
 
285 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  57.47 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  58.44 
 
 
347 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  55.26 
 
 
312 aa  63.2  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  58.21 
 
 
367 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  57.14 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2829  hypothetical protein  45 
 
 
143 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.29 
 
 
2449 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  24.58 
 
 
3472 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  24.58 
 
 
3471 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  26.67 
 
 
3521 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>