223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2159 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
391 aa  752    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 
402 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
385 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  32.96 
 
 
400 aa  182  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  30.59 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
394 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
387 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
388 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.73 
 
 
383 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  34.73 
 
 
383 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 
386 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  32.17 
 
 
384 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
390 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 
430 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.21 
 
 
386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
381 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
383 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.59 
 
 
396 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  32.41 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.82 
 
 
397 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
425 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  33.52 
 
 
398 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  32.87 
 
 
403 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  28.21 
 
 
397 aa  143  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  32.18 
 
 
400 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
433 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  28.69 
 
 
397 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.8 
 
 
432 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  34.59 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  28.69 
 
 
397 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 
390 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
387 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  34.07 
 
 
384 aa  137  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.38 
 
 
396 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  27.93 
 
 
404 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  31.05 
 
 
383 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  29.51 
 
 
397 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.23 
 
 
417 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  29.51 
 
 
397 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
465 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  31.34 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  27.27 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  30.89 
 
 
397 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  32.35 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  32.87 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  28.25 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  28.65 
 
 
402 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
402 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  28.65 
 
 
402 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  28.65 
 
 
402 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  28.65 
 
 
402 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  28.65 
 
 
402 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  31.55 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  28.65 
 
 
402 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 
392 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
401 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  31.36 
 
 
439 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  28.69 
 
 
375 aa  123  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  30.68 
 
 
409 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  29.49 
 
 
400 aa  123  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  34.01 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  28.18 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  27.9 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  28.18 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  32.29 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.65 
 
 
372 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  27.9 
 
 
403 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  28.88 
 
 
414 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  27.9 
 
 
403 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  29.55 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  31.93 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  29.55 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  29.55 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  29.55 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  29.55 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 
396 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
391 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  29.29 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  32.48 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  29.29 
 
 
378 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  30.85 
 
 
387 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  30.34 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.27 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  30.34 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>