60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2137 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  100 
 
 
184 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  89.62 
 
 
184 aa  344  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  52.07 
 
 
174 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  49.2 
 
 
187 aa  168  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.02 
 
 
180 aa  168  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  50.29 
 
 
184 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  47.7 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  46.37 
 
 
180 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  47.09 
 
 
180 aa  162  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.49 
 
 
182 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  50.29 
 
 
180 aa  158  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  46.55 
 
 
179 aa  157  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  45.56 
 
 
194 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  44.63 
 
 
192 aa  155  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  46.37 
 
 
187 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.37 
 
 
182 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  49.43 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.67 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  43.58 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  41.95 
 
 
186 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  41.95 
 
 
186 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  41.99 
 
 
211 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.37 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  42.2 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  40.98 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  43.26 
 
 
180 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.82 
 
 
177 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  46.1 
 
 
394 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  0.0000000000000462587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  46.11 
 
 
182 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  39.88 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  41.04 
 
 
186 aa  131  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  39.34 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  43.33 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  44.59 
 
 
215 aa  124  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  41.04 
 
 
184 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  41.04 
 
 
184 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  41.04 
 
 
184 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  41.04 
 
 
184 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  40.46 
 
 
194 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  40.46 
 
 
184 aa  121  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  40.46 
 
 
184 aa  121  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  31.38 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  33.89 
 
 
211 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  30.81 
 
 
207 aa  98.2  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56016  predicted protein  33.33 
 
 
209 aa  95.5  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.047688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  31.21 
 
 
216 aa  95.9  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  31.93 
 
 
209 aa  92.4  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  30.99 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  29.65 
 
 
209 aa  89  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  30.73 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  29.78 
 
 
253 aa  85.5  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  30.46 
 
 
216 aa  85.1  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21228  predicted protein  27 
 
 
225 aa  71.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0839  phosphotransferase KptA/Tpt1  25.58 
 
 
247 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4144  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like  47.46 
 
 
106 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00880983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4222  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  47.46 
 
 
83 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10567  tRNA splicing 2' phosphotransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_2G02890)  25.48 
 
 
350 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0307088 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00310  tRNA 2'-phosphotransferase, putative  30.77 
 
 
352 aa  53.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0508161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0385  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  65.62 
 
 
46 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1544  phosphotransferase KptA/Tpt1  22.99 
 
 
253 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00427558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>