More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2121 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  88.41 
 
 		 149 aa  254  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  72.52 
 
 		 134 aa  204  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  45.74 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  45.74 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  45.74 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  41.59 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  39.82 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  39.68 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  37.29 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  37.82 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  38.14 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  39.13 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  33.91 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  33.91 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 252 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  36.28 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 166 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 167 aa  57  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  36.22 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  31.39 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  50.75 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  33.87 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  31.01 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  31.01 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  31.78 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  31.01 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  31.31 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 212 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 473 aa  52  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>