148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1885 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1699  extracellular solute-binding protein family 1  93.32 
 
 		 419 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 419 aa  853    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3944  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.282645 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5076  extracellular solute-binding protein family 1  37.8 
 
 		 427 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340965  normal  0.383073 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5356  extracellular solute-binding protein family 1  36.14 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0798754  normal  0.176605 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5755  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  35 
 
 		 425 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0711  extracellular solute-binding protein family 1  31.57 
 
 		 436 aa  216  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3526  extracellular solute-binding protein family 1  32.33 
 
 		 435 aa  209  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.077506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3675  extracellular solute-binding protein family 1  32.54 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0659  extracellular solute-binding protein family 1  31.81 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0067  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  31.7 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.64 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.93 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.71 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.43 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.63 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.32 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.76 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.01 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.47 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.67 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.67 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.84 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  20.48 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  25.73 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 464 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.3 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.47 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  20.86 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.26 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.14 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 504 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.32 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  21.19 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  22.96 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  21.77 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  21.7 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  31.15 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  20.54 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  21.51 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1291  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.83 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>