51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1836 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  27.48 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  30.77 
 
 		 934 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  26.09 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  24.82 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  29.06 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  24.55 
 
 		 456 aa  97.1  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  28.98 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  25.12 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  22.99 
 
 		 441 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  24.75 
 
 		 439 aa  86.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  23.42 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  28.24 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  26.76 
 
 		 682 aa  79.3  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.36 
 
 		 748 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  23.27 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  33.17 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  26.09 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  27.71 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  23.99 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  23.99 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  23.99 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.99 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1047  saccharopine dehydrogenase  31.44 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.789456  normal  0.0319495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  26.56 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  23.65 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  27.27 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  24.11 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  22.79 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.52 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  23.98 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  23.98 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  23.34 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  23.51 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  22.78 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  29.07 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  24.76 
 
 		 367 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  28.08 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  30.15 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  22.41 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  22.91 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  23.75 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  26.42 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  23.21 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  24.82 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  26.42 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  26.42 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  26.42 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  26.42 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  22.46 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>