More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1789 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  85.31 
 
 
430 aa  799  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  75.7 
 
 
434 aa  717  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  69.77 
 
 
433 aa  655  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  75.59 
 
 
433 aa  702  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  72.01 
 
 
433 aa  654  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  71.96 
 
 
431 aa  676  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  74.36 
 
 
427 aa  687  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  69.53 
 
 
433 aa  645  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  82.28 
 
 
429 aa  761  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  73.41 
 
 
427 aa  685  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  91.61 
 
 
429 aa  843  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  69.53 
 
 
433 aa  650  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  88.81 
 
 
429 aa  814  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  76.4 
 
 
434 aa  716  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  72.73 
 
 
428 aa  675  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  82.75 
 
 
430 aa  767  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  70.19 
 
 
430 aa  658  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  78.09 
 
 
429 aa  729  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  76.53 
 
 
434 aa  717  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  68.79 
 
 
424 aa  642  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  69.63 
 
 
432 aa  652  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  85.08 
 
 
429 aa  794  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  81.59 
 
 
429 aa  759  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  86.01 
 
 
435 aa  803  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  73 
 
 
428 aa  675  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  82.28 
 
 
429 aa  762  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  76.87 
 
 
434 aa  722  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  70.23 
 
 
429 aa  641  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  70.47 
 
 
433 aa  654  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  70.47 
 
 
433 aa  654  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  76.92 
 
 
430 aa  721  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  70.47 
 
 
433 aa  654  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  70.47 
 
 
433 aa  654  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  70.93 
 
 
428 aa  651  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  6.89188e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  98.37 
 
 
429 aa  889  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  69.39 
 
 
432 aa  650  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  74.12 
 
 
434 aa  683  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  69.3 
 
 
433 aa  646  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  77.93 
 
 
434 aa  724  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  70.47 
 
 
433 aa  654  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  69.53 
 
 
433 aa  645  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  70 
 
 
431 aa  649  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  69.3 
 
 
433 aa  649  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  72.54 
 
 
430 aa  666  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  72.3 
 
 
428 aa  671  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  72.06 
 
 
433 aa  666  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  82.86 
 
 
436 aa  760  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  82.28 
 
 
446 aa  760  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  70.23 
 
 
433 aa  652  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  75.93 
 
 
433 aa  716  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  69.53 
 
 
433 aa  645  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  69.23 
 
 
426 aa  635  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  68.6 
 
 
433 aa  636  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  70.87 
 
 
433 aa  634  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  70 
 
 
429 aa  643  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  69.53 
 
 
429 aa  634  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  86.01 
 
 
430 aa  802  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  82.31 
 
 
429 aa  751  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1806  citrate synthase  73.24 
 
 
430 aa  663  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.218068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  70.47 
 
 
433 aa  654  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  70.47 
 
 
433 aa  654  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  82.75 
 
 
430 aa  766  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  77.93 
 
 
438 aa  727  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  69.77 
 
 
429 aa  643  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  70.7 
 
 
433 aa  655  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  100 
 
 
429 aa  899  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  69.1 
 
 
432 aa  645  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  69.53 
 
 
433 aa  645  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  72.3 
 
 
428 aa  670  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  69.3 
 
 
433 aa  646  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  68.36 
 
 
436 aa  631  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  69.07 
 
 
429 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  69.07 
 
 
429 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  69.77 
 
 
427 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  69.77 
 
 
427 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  70.47 
 
 
430 aa  628  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  70.47 
 
 
428 aa  627  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.81967e-06  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  68.84 
 
 
429 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  69.77 
 
 
427 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.51297e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  69.3 
 
 
427 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  69.77 
 
 
427 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  67.37 
 
 
425 aa  630  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  69.77 
 
 
427 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  68.69 
 
 
439 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  67.51 
 
 
436 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  68.26 
 
 
433 aa  629  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  69.07 
 
 
429 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  67.91 
 
 
433 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  68.53 
 
 
432 aa  627  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  70 
 
 
429 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  70.28 
 
 
428 aa  624  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  68.84 
 
 
429 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  70.93 
 
 
428 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  70.93 
 
 
428 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3605  type II citrate synthase  67.51 
 
 
436 aa  624  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.113528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  70.93 
 
 
428 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.56312e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  70.93 
 
 
428 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  67.91 
 
 
427 aa  625  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  68.14 
 
 
429 aa  624  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  70.93 
 
 
428 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>